Благословенная Бухара – центр исламской культуры и древнейшей истории Узбекистана. На протяжении двухтысячелетней истории этот город был свидетелем больших исторических событий и жестоких кровопролитных боев. Одним из таких боев произошел в 1511-1512 гг между войсками тимурида Бабура и узбекского хана Шейбанихана. В ноябре 1512 года под Гиждуваном войско узбеков одержало верх над объединённой армией Мухаммада Бабура. Правителем Бухары был назначен победитель Гиждуванской битвы Убайдулла-хан, племянник Мухаммада Шейбани-хана, знаток Корана, талантливый поэт и покровитель учёных.
Именно при Убайдулла-хане произошел настоящий расцвет Бухары, город обрел свой уникальный архитектурный стиль. В 1514 году была отреставрирована соборная мечеть Калон, построенная при караханиде Арслан-хане (1102—1130) одна из крупнейших в Мавераннахре до 1404 года, когда было завершено строительство мечети Биби-Ханым в Самарканде, построенный внуком Темура Улугбеком. По приказу Убайдуллы-хана фасад мечети был украшен грандиозным пештаком и был установлен новый михраб.
Неподалеку от мечети Бибиханым в 1530 году было начато строительство медресе Мири Араб, которое превосходило по размерам медресе Улугбека в Самарканде. Новое медресе было названо в честь арабского ученого, выходца из Йемена Амира Абдуллы аль-Ямани, ученика влиятельного накшбандийского шейха Ходжи Ахрара и духовного наставника Убайдуллы-хана.
Медресе Мири Араб сегодня является частью архитектурного ансамбля Пои-Калон, в который входят мечеть и минарет Калон и медресе эмира Алимхана. Главный фасад медресе смотрит на минарет Калон. Вход в медресе украшает величественный и богато украшенный пештак с глубокой нишей, по краям фасада расположены массивные башни-гульдасата.
Если войти через центральный вход справа можно увидеть мраморную усыпальницу шейха Абдуллы аль-Ямани и предполагаемое место захоронения самого Убайдуллы-хана. Помещения охраняют два купола, облицованные голубой плитой.
Во внутреннем дворе располагаются учебные комнаты – худжры, а летние аудитории выполнены в виде айванов с небольшими порталами.
Медресе Мири Араб всегда считалось центром исламского духовного образования, в его стенах обучались видные духовные деятели и муфтии. Деятельность медресе была приостановлена в 1920 году, когда Бухарский эмират был захвачен большевиками. После Второй мировой войны, Советское правительство поменяло свое отношение к религии и постепенно начало открывать духовные учреждения.
В 1943 году Курултай мусульманских улемов в Ташкенте учредил Духовное управление мусульман Средней Азии и Казахстана, председателем которого был назначен шейх Эшона Бабахан ибн Абдулмажидхан. Именно стараниями шейха в 1945 году медресе Мири Араб было восстановлено и получило статус образовательного учреждения.
Выпускниками медресе Мири Араб в разное время были известные духовные и политические лидеры, муфтии и даже главы некоторых государств.
Среди наиболее известных: главный муфтий Узбекистана и председатель Управления мусульман Узбекистана Усманхан Алимов, председатель совета муфтиев России Равиль Гайнутдин, муфтий Азербайджана Аллахшукюр Пашазаде, муфтий Казахстана Ратбек Нысанбайулы, Президент Чеченской Республики Ахмад Кадыров, Верховный муфтий России Таджуддин Талгат Сафич, председатель Духовного Управления Мусульман Средней Азии и Казахстана шейх Мухаммад Садык Мухаммад Юсуф.